イネいもち病菌発現遺伝子標識（ＥＳＴ）データベースを公開

- イネいもち病菌の遺伝子確定に役立つ約３万５千の塩基配列の構造や機能が明らかに -

ポイント

約３万５千のイネいもち病菌発現遺伝子標識（ＥＳＴ）配列の解読に成功
解読したEST配列と遺伝子情報をデータベース化し公開
イネいもち病の発生メカニズムの解明に大きく貢献することが期待

概要

農業生物資源研究所は、イネいもち病菌発現遺伝子標識（ＥＳＴ）データベースを構築し、２００９年１月３０日よりウェブサイト上（http://mg.dna.affrc.go.jp/）で公開しました。

イネいもち病菌は稲作に深刻な被害をもたらす病原菌の一種です。イネいもち病菌の全ゲノム配列はすでに決定されていますが、イネいもち病菌のもつ遺伝子の構造や機能については十分に解明されていませんでした。

今回、イネいもち病菌の遺伝子情報の全体像を詳細に理解するために、イネいもち病菌ｃＤＮＡクローン18,821を作製し、それらのクローンの両端から数百塩基の配列を決定しました。これらの配列は発現遺伝子標識（ＥＳＴ）と呼ばれ、読み取った約３万５千のＥＳＴ配列情報をデータベース化しました。

公開したデータベースには、解読したＥＳＴ配列のほか、コンピューター解析により得られた遺伝子の構造や機能に関する情報が格納されています。また、このデータベースは遺伝子の名前や機能に関連するキーワードで検索ができ、検索結果を分かりやすく表示できるブラウザを備えています。

公開したデータベース及びｃＤＮＡクローンがイネに被害を及ぼす原因遺伝子の詳細解明に大きく貢献することが期待されます。この成果の概要は専門誌である FEBS Letters に掲載予定で、これに先立ち２００９年１月３０日にオンライン版で公表されました。

予算：

交付金プロ「共生系」（2005年度）、農林水産省委託プロジェクト「昆虫テクノロジー」（2003～2004年度）及び「新農業展開ゲノム」（2008～2012年度）

参考資料 [PDFファイル：239キロバイト]

Hisataka Numa, Marie Nishimura, Tsuyoshi Tanaka, Hiroyuki Kanamori, Ching-chia Yang, Takashi Matsumoto, Yoshiaki Nagamura, Takeshi Itoh
Genome-wide validation of Magnaporthe grisea gene structures based on transcription evidence
FEBS Letters, Volume 583, Issue 4, 18 February 2009, Pages 797-800, doi:10.1016/j.febslet.2009.01.041

問い合わせ先など

（独）農業生物資源研究所茨城県つくば市理事長		石毛光雄
研究推進責任者：	（独）農業生物資源研究所ゲノム情報研究ユニット長	伊藤　　剛
	電話番号：０２９－８３８－７０６５、電子メール：taitoh@affrc.go.jp
広報担当者：	（独）農業生物資源研究所広報室長	新野孝男
	電話番号：０２９－８３８－８４６９

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