果樹研究所

Minimal Marker

Minimal Markerとは

Minimalmarkerは、共優性マーカーあるいは優性マーカーを多数の品種に適用して得られた多型データから、最も少ないマーカー数で、すべての品種を判別するためのマーカーセットを検出するコンピュータプログラムです.多くの場合、多くの品種に多数のマーカーを適用して得られた結果をまとめた表において、すべての品種を判別するのにすべてのマーカーを使用する必要はありません。もし、MinimalMarkerによって最少マーカーセット(すべての品種を判別することができるマーカーセットの中で、最もマーカー数が少ないマーカーセット)が判れば、品種判別のための労力や時間を節約できます。

使用環境

Perl5環境があれば、WindowsでもMac OSXでもLinuxでも動作します。Mac OSXやLinuxの場合は多くの場合、Perl環境は設定済みです。
Windowsの場合は、ActivePerl (http://www.activestate.com/Products/ActivePerl/Download.html)などをインストールしてください。

免責事項

  • 独立行政法人 農業・食品産業技術総合研究機構 (以下農研機構と記します)は、本ソフトウエアに関して不具合やエラーや障害が生じないことを一切保証いたしません。
  • 農研機構は、本ソフトウエア及び本ソフトウエアのダウンロードに起因してご使用者に直接または間接的損害が生じても、いかなる責任をも負わず、一切の損害賠償を行わないものとします。
  • 農研機構は、本ソフトウエアに不具合、不備等があっても、程度の如何にかかわらず訂正、修補する義務を負わないものとします。

著作権その他の権利

  • ソフトウエアの著作権その他の知的財産権一切は、農研機構に帰属します。
  • 本ソフトウエアを無断で複製、転載、改変などに類する行為と無断で解析(逆コンパイル、逆アセンブル、リバースエンジニアリング等)することを禁止します。
  • 本ソフトウエアを販売、貸与、再使用許諾、営業使用することなどはいずれもできないものとします。事前の告知なしに本ソフトウエアの変更、又は配布を中止する場合があります。また、このページは予告無く加筆修正されることがあります。

インストール方法

  • Perl5の実行環境をインストールしてください。
  • 下記のリンクからMinimalMarkerをダウンロードしてください。
    本プログラムは、ZIP形式で圧縮してあります。
  • 解凍すると本プログラムと取扱説明書およびサンプル入力データファイルと出力データファイルがあらわれます。
  • 本プログラムを適当なディレクトリに置いてください。