ばれいしょの病害虫抵抗性遺伝子を選抜するDNAマーカー

［要約］

DNAマーカーによって、ジャガイモシストセンチュウ抵抗性遺伝子H1およびジャガイモYウイルス抵抗性遺伝子Rychcを判定できる。

［キーワード］

ジャガイモシストセンチュウ、ジャガイモYウイルス、抵抗性遺伝子、DNAマーカー

［担当］道立中央農試・基盤研究部・遺伝子工学科
［代表連絡先］電話0123-89-2584
［区分］北海道農業・生物工学
［分類］研究・普及

［背景・ねらい］

ばれいしょの病害虫抵抗性品種を早期に育成するために、ジャガイモシストセンチュウ抵抗性遺伝子H1およびジャガイモYウイルス抵抗性遺伝子Rychcを検出するDNAマーカーを開発する。現在、実用的なDNAマーカーはないことから、高精度で使いやすいマーカーの開発をめざす。

［成果の内容・特徴］

1. DNAマーカーによって、ジャガイモシストセンチュウ抵抗性遺伝子H1およびジャガイモYウイルス抵抗性遺伝子Rychcを判定できる（表１）。PCR反応は、HotStar Taq DNA Polymerase(QIAGEN)を利用する。アニーリング温度は55℃とする。
2. H1遺伝子、Rychc遺伝子ともに、遺伝子の両側を挟む2マーカーを同時に増幅することにより、精度よく検定できる。また、ばれいしょの顆粒性澱粉合成酵素遺伝子GBSSを検出するプライマーペアを追加し、必ず981bpの増幅断片が得られるように設計することでPCR作業エラーによる誤判定を回避できる（図１）。
3. 一個体から抽出したDNAでシストセンチュウおよびYウイルス抵抗性遺伝子のマーカー検定に利用できるため、効率的である。
4. 検定期間は、従来法ではシストセンチュウおよびYウイルスともに2〜3か月間を要したが、DNAマーカー検定では1日に200点程度を処理できる。
5. 検定試料は、従来法では休眠を打破した塊茎が必要であるが、DNAマーカー検定では葉に加え、塊茎からのDNA抽出法（表２）も確立したため、検定は通年で実施可能である。