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- イネアノテーションデータベース (RAP-DB)
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- イネ遺伝子共発現データベース (RiceFREND）
- 圃場におけるイネ遺伝子発現データベース (FiT-DB）
- イネ完全長cDNAデータベース （KOME）
- ミュータントパネルデータベース (Tos17）
- QTLアノテーションオンラインデータベース (Q-TARO）
- シスエレメントモチーフ検索データベース (PLACE)
- イネゲノムアノテーションデータベース (RiceGAAS)
- イネプロテオームデータベース (Rice Proteome Database)
- イネミトコンドリアゲノム情報 (RMG information)
- 植物ゲノム断片配列アノテーションパイプライン（Flowering Plant Gene Picker)
昆虫ゲノム
- カイコ統合ゲノム情報データベース (KAIKObase)
- カイコcDNA(EST)情報 (KAIKOcDNA)
- カイコプロテオームデータベース (KAIKO 2DDB)
- カイコゲノムデータBLAST検索 (KAIKOBLAST)
- カイコゲノムアノテーションデータベース (KAIKOGAAS)
- Bombys Trap データベース
- トビイロウンカEST情報 (UNKA(BPH)EST)
- トビイロウンカマーカーデータベース
- コナガゲノムデータベース (KONAGAbase)