ダイズの難裂莢性DNAマーカー

［要約］

［キーワード］

ダイズ、機械収穫適性、難裂莢性、マーカー育種、高精度マッピング

［担当］北海道農研・低温耐性研究チーム、作物研・大豆育種研究チーム、道立十勝農試・大豆科、道立中央農試・畑作科、北海道大学・農学研究院
［代表連絡先］電話011-857-9260、電子メールseika-narch@naro.affrc.go.jp
［区分］北海道農業・生物工学、作物
［分類］研究・普及

［背景・ねらい］

近年、ダイズ栽培においてコンバイン収穫が全国的に普及し、それに適した品種の育成が求められている。莢がはじけにくい性質（難裂莢性）はそのために重要な形質であるが、国内で育成された難裂莢性品種は少なく、普及面積は10%に満たない。全国に対応した品種群を迅速に育成するためには、難裂莢性に関する簡便かつ高精度なマーカー選抜システムが必要である。そこで、北海道で利用実績のある、タイ品種「SJ2」由来の難裂莢性遺伝子に強連鎖し、かつ国内の主要な易裂莢性品種と多型を示すDNAマーカーを高精度マッピングにより開発し、その効果を明らかにする。

［成果の内容・特徴］

「SJ2」由来の難裂莢性遺伝子が座乗する遺伝子座qPDH1は、第16染色体（旧分子連鎖群J）の29547kb（マーカーA）から29681kb（マーカーB）までの領域内に存在する（図１）。
「SJ2」と易裂莢性品種「トヨムスメ」とのゲノムを比較すると、この領域で挿入／欠失配列が見いだされ（図１）、その配列をもとに設計したPCRベースのマーカーがSRM1、SRM2である（表）。いずれのマーカーも難裂莢性遺伝子との遺伝距離は0.2cM未満と推定される。
「SJ2」由来の難裂莢性品種・系統（ハヤヒカリ、ユキホマレ、十系992号、CH001）は、すべてSRM1およびSRM2に関して「SJ2」と同じ対立遺伝子型を示す（表）。
一方、裂莢性が易から中程度の国内主要品種（トヨムスメ、キタムスメ、トヨハルカ、フクユタカ、タチナガハ、サチユタカ、エンレイ、リュウホウ、スズユタカ、すずかおり、あやこがね、ナカセンナリ、ことゆたか、ふくいぶき）は、SRM1に関して、すべて「SJ2」と多型を示す（表）。
「すずかおり」以外の上記主要品種は、SRM2に関しても、「SJ2」と多型を示す（表）。
対立遺伝子型（増幅されるDNA断片の長さ）の差異に基づき（表）、SRM1は小型のポリアクリルアミドゲル電気泳動で、SRM2はアガロースゲル電気泳動で簡易に判別ができる。
「SJ2」由来の難裂莢性遺伝子をもつ品種・系統と易裂莢性品種・系統の交雑後代では、栽培地に関係なく、SRM1が「SJ2」型のものは難裂莢性になる（図２）。

［成果の活用面・留意点］

ダイズの難裂莢性に関するマーカー選抜に利用できる。

［具体的データ］

［その他］

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