キュウリ黄化えそ病ウイルスのRT-LAMP法を用いた高感度かつ簡易な検出法


[要約]
RT-LAMP法を用ることで、キュウリ黄化えそ病ウイルス(MYSV)をELISA法及びRT-PCR法より高感度かつ簡易に検出できる。

[キーワード]キュウリ、黄化えそ病、MYSV、RT-LAMP法、高感度、簡易検出

[担当]群馬農技セ・生産環境部・植物保護グループ
[代表連絡先]電話:0270-30-7799
[区分]関東東海北陸農業・関東東海・病害虫(病害)
[分類]技術・参考

[背景・ねらい]
  群馬県内の施設栽培キュウリにおいて、Melon Yellow Spot Virus (MYSV)によるキュウリ黄化えそ病の発生が問題となっている。県内の平坦地を中心に発生面積が増加しているため、現地では迅速な診断による防除対策が求められている。そこで、RT-LAMP(Loop-Mediated Isothermal Amplification)法を用いた現場で活用できる高感度で簡易な検出法を開発する。

[成果の内容・特徴]
1. MYSV検出用LAMPプライマーは、データベースに登録されたMYSV分離株の遺伝子配列情報を基に、LAMP法プライマー設計支援ソフト「PrimerExplorer Ver.3(富士通)」を用いて作成した(表1)。
2. キュウリのMYSV感染葉から抽出した全RNAを対象とした場合、上記プライマーを用いたRT-LAMP法は、RT-PCR法と比較して、検出感度が100倍高い(図1)。
3. 植物磨砕液をそのまま用いた場合でも、RT-LAMP法はMYSVの検出が可能であり、ELISA法と比較して10〜100倍の高い検出感度である(図2)。

[成果の活用面・留意点]
1. 検出感度が高いため、試料のコンタミネーションによって、擬陽性を示しやすいので、試料調製時の操作には注意する。
2. RT-LAMP法で処理した検体は、電気泳動を行わなくとも蛍光・目視検出試薬を添加することで、紫外線下での発光反応(図2)及び可視光線下で緑色への呈色反応(図略)により、目視でMYSVを容易に検出できる。
3. RT-LAMP法は、一定温度(65℃付近)に保温することで反応が進むため、PCR装置等の特別な機器は必要なく、恒温器1台があれば実施可能である。
4. 操作に要する時間は、RT-PCR法で5時間程度、ELISA法で7時間程度であるのに対し、RT-LAMP法は1時間程度で済み、現場で迅速に検定できる。
5. RT-LAMP法を用いた診断を営利目的で行う場合は、栄研化学株式会社に対し、本法に関する特許の実施許諾契約が必要となる。


[具体的データ]

表1 MYSV検出用LAMPプライマーの塩基配列
図1 キュウリ葉からの抽出全RNAに対するRT-LAMP法とRT-PCR法によるMYSV検出感度の比較
図2 キュウリ葉磨砕液を用いた場合のRT-LAMP法とELISA法によるMYSV検出感度の比較

[その他]
研究課題名:RT-LAMP法を用いたMelon Yellow Spot Virus (MYSV)の簡易検出法の開発
予算区分:県単
研究期間:2006年度
研究担当者:桑原克也

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