イチゴの四季成り性品種は、日長に関わらず花芽分化するため、夏秋期に生産ができる。この四季成り性の遺伝は、単一優性遺伝子を仮定した理論分離比によく適合することが知られている。そこで、DNAマーカーによる四季成り性と一季成り性の幼苗検定技術を確立するため、四季成り性遺伝子座に連鎖するPCRを利用したDNAマーカーを開発する。

1. ISSR（Inter-Simple sequence Repeat）マーカーのISSR110（436bp）とISSR116（575bp）（図１a、ｂ）をクローニングし、塩基配列中にある縦列反復配列を挟むようにSSRマーカーのMSFA110とMSFA116のプライマー対を設計している（図１ｃ、ｄ）。
2. MSFA110とMSFA116の両マーカーは、四季成り性遺伝子座の片側に座乗している。四季成り性品種「エバーベリー」の自殖第一代84系統から算出した四季成り性遺伝子座との組換え価は、それぞれ8.9％と23％である（表１）。マーカー選抜した場合に推定される四季成り性の適合率（実際の四季成り性系統／マーカーで四季成り性と判定した系統）は、それぞれ96％と82％である。

1. プライマーの塩基配列については問い合わせに対応する。
2. MSFA110は２塩基の縦列反復配列，MSFA116は６塩基の縦列反復配列をもつ。これら縦列反復配列に依存した４塩基以上のPCR産物の長さの違いは、２〜５％TBEアガロースゲルで確認できる。
3. MSFA110とMSFA116は、SSRマーカーの特徴である多対立遺伝子（multi-alleles）をもつ。四季成り性品種と一季成り性品種の遺伝子型の違いとともに、四季成り性品種間の遺伝子型も識別できる。