業績リスト
2013年8月22日更新
GM環境耐性（GMB） 研究成果の公表
研究成果（平成24年度）
| 課題番号 | 発表区分 | 著者名: タイトル 雑誌名・URL 巻(号): ページ (発表年) |
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|---|---|---|---|---|
| GMB0001 | 原著論文 | R. Takahashi, Y. Ishimaru, H.
Shimo, Y. Ogo, T. Senoura, N. K. Nishizawa, H. Nakanishi:
The OsHMA2 transporter is involved in root-to-shoot translocation of Zn and Cd in rice. Plant Cell Environ 35(11):1948-1957(2012) |
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| GMB0001 | 原著論文 | R. Takahashi, K. Bashir, Y.
Ishimaru, N. K. Nishizawa, H. Nakanishi:
The role of heavy-metal ATPases, HMAs, in zinc and cadmium transport in rice. Plant Signal Behav 7(12):1605-1607(2012) |
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| GMB0001 | 原著論文 | Y. Ishimaru, K. Bashir, H.
Nakanishi, N. K. Nishizawa:
OsNRAMP5, a major player for constitutive iron and manganese uptake in rice. Plant Signal Behav 7(7):763-766(2012) |
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| GMB0001 | 原著論文 | Y. Ishimaru, R. Takahashi, K.
Bashir, H. Shimo, T. Senoura, K. Sugimoto, K. Ono, M. Yano, S. Ishikawa, T.
Arao, H. Nakanishi, N. K. Nishizawa:
Characterizing the role of rice NRAMP5 in Manganese, Iron and Cadmium Transport. Sci Rep 2:286(2012) |
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| GMB0001 | 新聞、テレビなどの広報 | 中西 啓仁, 石丸 泰寛, 高橋 竜一, バシル クーラム, 西澤
直子:
ファイトレメディエーション用カドミウム高吸収イネの開発に成功 ―イネのカドミウム集積を決めるキー遺伝子を発見―. (2012) |
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| GMB0002 | 原著論文 | Yoshihiko NANASATO, Ken-ichi
KONAGAYA, Ayako OKUZAKI, Mai TSUDA, Yutaka TABEI:
Improvement of Agrobacterium-mediated transformation of cucumber (Cucumis sativus L.) by combination of vacuum infiltration and co-cultivation on filter paper wicks. Plant Biotechnol. Rep. 7(3):267-276(2012) |
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| GMB0004 | 原著論文 | T. Mase, H. Yabuki, M. Okai, J.
Ohtsuka, F. L. Imai, Y. Nagata, M. Tanokura:
Crystallization and preliminary X-ray analysis of the haloalkane dehalogenase DatA from Agrobacterium tumefaciens C58. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 68(Pt 6):652-654(2012) |
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| GMB0004 | 原著論文 | M Ito, A. Ono, Y. Ohtsubo, M.
Tsuda, Y. Nagata:
Cloning of γ-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase gene with its flanking regions from soil by activity-based screening techniques. European J. Soil Biology 52:16-19(2012) |
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| GMB0004 | その他の出版物 | Nagata Y, S. Ohhata M. Tabata, M.
Tsuda:
Appearance and evolution of γ-hexachloro- cyclohexane-degrading bacteria. Biodegradative Bacteria :19-41(2013) |
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研究成果（平成23年度）
| 課題番号 | 発表区分 | 著者名: タイトル 雑誌名・URL 巻(号): ページ (発表年) |
|---|---|---|
| GMB0001 | 原著論文 | Y. Ishimaru, R. Takahashi, K.
Bashir, H. Shimo, T. Senoura, K. Sugimoto, K. Ono, M. Yano, S. Ishikawa, T.
Arao, H. Nakanishi, N. K. Nishizawa:
Characterizing the role of rice NRAMP5 in Manganese, Iron and Cadmium Transport. Sci Rep 2:286 (2012) |
| GMB0001 | 原著論文 | Khurram Bashir, Yasuhiro Ishimaru,
Hugo Shimo, Yusuke Kakei, Takeshi Senoura, Ryuichi Takahashi, Yutaka Sato,
Yuki Sato, Nobuyuki Uozumi, Hiromi Nakanishi, Naoko K. Nishizawa:
Rice phenolics efflux transporter 2 (PEZ2) plays an important role in solubilizing apoplasmic iron. Soil Sci. Plant Nutr. 57(6):803-812 (2012) |
| GMB0001 | 原著論文 | Y. Ishimaru, Y. Kakei, H. Shimo,
K. Bashir, Y. Sato, N. Uozumi, H. Nakanishi, N. K. Nishizawa:
A rice phenolic efflux transporter is essential for solubilizing precipitated apoplasmic iron in the plant stele. J Biol Chem 286(28):24649-24655 (2011) |
| GMB0001 | 原著論文 | R. Takahashi, Y. Ishimaru, T.
Senoura, H. Shimo, S. Ishikawa, T. Arao, H. Nakanishi, N. K. Nishizawa:
The OsNRAMP1 iron transporter is involved in Cd accumulation in rice. J Exp Bot 62(14):4843-4850 (2011) |
| GMB0001 | 原著論文 | H. Shimo, Y. Ishimaru, G. An, T.
Yamakawa, H. Nakanishi, N. K. Nishizawa:
Low cadmium (LCD), a novel gene related to cadmium tolerance and accumulation in rice. J Exp Bot 62(15):5727-5734 (2011) |
| GMB0001 | 原著論文 | Y. Ishimaru, K. Bashir, H.
Nakanishi, N. K. Nishizawa:
The role of rice phenolics efflux transporter in solubilizing apoplasmic iron. Plant Signal Behav 6(10):1624-1626 (2011) |
| GMB0001 | 原著論文 | R. Takahashi, Y. Ishimaru, H.
Nakanishi, N. K. Nishizawa:
Role of the iron transporter OsNRAMP1 in cadmium uptake and accumulation in rice. Plant Signal Behav 6(11):1813-1816 (2011) |
| GMB0002 | 原著論文 | Y. Nanasato, K. Konagaya, A.
Okuzaki, M. Tsuda, Y. Tabei:
Agrobacterium-mediated transformation of kabocha squash (Cucurbita moschata Duch) induced by wounding with aluminum borate whiskers. Plant Cell Rep 30(8):1455-1464 (2011) |
| GMB0004 | 原著論文 | K. Hasan, A. Fortova, T.
Koudelakova, R. Chaloupkova, M. Ishitsuka, Y. Nagata, J. Damborsky, Z.
Prokop:
Biochemical characteristics of the novel haloalkane dehalogenase DatA, isolated from the plant pathogen Agrobacterium tumefaciens C58. Appl Environ Microbiol 77(5):1881-1884 (2011) |
| GMB0004 | 原著論文 | M. Tabata, R. Endo, M. Ito, Y.
Ohtsubo, A. Kumar, M. Tsuda, Y. Nagata:
The lin genes for gamma-hexachlorocyclohexane degradation in Sphingomonas sp. MM-1 proved to be dispersed across multiple plasmids. Biosci Biotechnol Biochem 75(3):466-472 (2011) |
| GMB0004 | 原著論文 | T. Prudnikova, R. Chalouplova, Y.
Sato, Y. Nagata, O. Degtjarik, M. Kuty, P. Rezacova, J. Damborsky, I.
Smatanova:
Development of a crystallization protocol for the DbeA1 variant of novel haloalkane dehalogenase from Bradyrhizobium elkkani USDA94. Cryst. Growth Des. 11(2):516-519 (2011) |
| GMB0004 | 原著論文 | Y. Nagata, S. Natsui, R. Endo, Y.
Ohtsubo, N. Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, M. Tsuda:
Genomic organization and genomic structural rearrangements of Sphingobium japonicum UT26, an archetypal gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium. Enzyme Microb Technol 49(6-7):499-508 (2011) |
| GMB0004 | 原著論文 | R. Chaloupkova, Z. Prokop, Y.
Sato, Y. Nagata, J. Damborsky:
Stereoselectivity and conformational stability of haloalkane dehalogenase DbjA from Bradyrhizobium japonicum USDA110: the effect of pH and temperature. Febs J 278(15):2728-2738 (2011) |
| GMB0004 | 原著論文 | 佐藤優花里, 夏目亮, Z. Prokop, J.
Brezovsky, R. Chaloupkova, J. Damborsky, 永田裕二, 千田俊哉:
ハロアルカン脱ハロゲン酵素DbjAの鏡像異性体選択性機構の解明. 日本結晶学会誌 53(2):124-129 (2011) |
| GMB0005 | 原著論文 | A. T. Nguyen, Y. Sato, T. Iwasaki,
K. Miyauchi, M. Tokuda, D. Kasai, E. Masai, M. Fukuda:
Characterization of the 1,1-dichloro-2,2-bis(4-chlorophenyl)ethylene (DDE) degradation system in Janibacter sp. TYM3221. Enzyme Microb Technol 49(6-7):532-539 (2011) |
| GMB0006 | 原著論文 | K. Yamazaki, M. Suzuki, T. Itoh,
K. Yamamoto, M. Kanemitsu, C. Matsumura, T. Nakano, T. Sakaki, Y. Fukami, H.
Imaishi, H. Inui:
Structural basis of species differences between human and experimental animal CYP1A1s in metabolism of 3,3',4,4',5-pentachlorobiphenyl. J Biochem 149(4):487-494 (2011) |
| GMB0006 | その他の出版物 | 大川秀郎, 乾秀之, 嶋津小百合:
第２章ファイトレメディエーション：植物による土壌浄化技術、６ 残留農薬のファイトレメディエーションとポリ塩化ビフェニル（PCB）などのファイトモニタリング. 植物機能のポテンシャルを活かした環境保全・浄化技術ー地球を救う超環境適合・自然調和型システムー 92-99 (2011) |
| GMB0006 | 受賞 | 薮未来, 山崎清志, 鈴木元治, 羽賀雄紀, 伊藤俊将, 山本恵子,
鶴川正寛, 松村千里, 中野武, 榊利之, 乾秀之:
ラットおよびヒトCYP1A1によるポリ塩化ビフェニルの代謝と３次元構造の比較. 第２０回環境化学討論会優秀学生賞 (2011) |
研究成果（平成22年度）
| 課題番号 | 発表区分 | 著者名: タイトル 雑誌名・URL 巻(号): ページ (発表年) |
|---|---|---|
| GMB0004 | 原著論文 | Z. Prokop, Y. Sato, J. Brezovsky,
T. Mozga, R. Chaloupkova, T. Koudelakova, P. Jerabek, V. Stepankova, R.
Natsume, J. G. van Leeuwen, D. B. Janssen, J. Florian, Y. Nagata, T. Senda,
J. Damborsky:
Enantioselectivity of haloalkane dehalogenases and its modulation by surface loop engineering Angew Chem Int Ed Engl 49(35):6111-6115 (2010) |
| GMB0004 | 原著論文 | Y. Nagata, Y. Ohtsubo, R. Endo, N.
Ichikawa, A. Ankai, A. Oguchi, S. Fukui, N. Fujita, M. Tsuda:
Complete genome sequence of the representative gamma-hexachlorocyclohexane-degrading bacterium Sphingobium japonicum UT26 J Bacteriol 192(21):5852-5853 (2010) |
| GMB0004 | 原著論文 | M. Okai, K. Kubota, M. Fukuda, Y.
Nagata, K. Nagata, M. Tanokura:
Crystal structure of gamma-hexachlorocyclohexane Dehydrochlorinase LinA from Sphingobium japonicum UT26 J Mol Biol 403(2):260-269 (2010) |
| GMB0004 | 総説 | 永田裕二, 津田雅孝:
脱ハロゲン酵素 酵素利用技術大系 :939-948 (2010) |
| GMB0004 | 総説 | 永田裕二, 津田雅孝:
環境汚染物質分解細菌のメタゲノミクス 難培養微生物研究の最新技術 II 〜 ゲノム解析を中心とした最前線と将来展望〜 :211-219 (2010) |
| GMB0005 | 原著論文 | H. Takeda, J. Shimodaira, K.
Yukawa, N. Hara, D. Kasai, K. Miyauchi, E. Masai, M. Fukuda:
Dual two-component regulatory systems are involved in aromatic compound degradation in a polychlorinated-biphenyl degrader, Rhodococcus jostii RHA1 J Bacteriol 192(18):4741-4751 (2010) |
| GMB0006 | その他の出版物 | K. Yamazaki, H. and Inui:
Phytoremediation with genetically modified plants Trends in Bioremediation and Phytoremediation:in press (2011) |
| GMB0007 | 原著論文 | H. Murano, T. Otani, N. Seike:
Dieldrin-dissolving abilities of the xylem saps of several plant families, particularly Cucurbita pepo L Environ Toxicol Chem 29(10):2269-2277 (2010) |
研究成果（平成21年度）
| 課題番号 | 発表区分 | 著者名: タイトル 雑誌名・学会名・URL 巻(号): ページ (発表年) |
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|---|---|---|---|---|
| GMB0001 | 原著論文 | Ippei Ogawa, Hiromi Nakanishi,
Satoshi Mori, Naoko K. Nishizawa:
Time course analysis of gene regulation under cadmium stress in rice. Plant Soil 325(1-2): 97-108 (2009) |
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| GMB0004 | 原著論文 | M. Okai, K. Kubota, M. Fukuda, Y.
Nagata, K. Nagata, M. Tanokura:
Crystallization and preliminary X-ray analysis of gamma-hexachlorocyclohexane dehydrochlorinase LinA from Sphingobium japonicum UT26. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 65(Pt 8): 822-824 (2009) |
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| GMB0004 | 原著論文 | T. Prudnikova, T. Mozga, P.
Rezacova, R. Chaloupkova, Y. Sato, Y. Nagata, J. Brynda, M. Kuty, J.
Damborsky, I. K. Smatanova:
Crystallization and preliminary X-ray analysis of a novel haloalkane dehalogenase DbeA from Bradyrhizobium elkani USDA94. Acta Crystallogr Sect F Struct Biol Cryst Commun 65(Pt 4): 353-356 (2009) |
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| GMB0004 | 原著論文 | M. Pavlova, M. Klvana, Z. Prokop,
R. Chaloupkova, P. Banas, M. Otyepka, R. C. Wade, M. Tsuda, Y. Nagata, J.
Damborsky:
Redesigning dehalogenase access tunnels as a strategy for degrading an anthropogenic substrate. Nat Chem Biol 5(10): 727-733 (2009) |
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| GMB0004 | 総説 | 大坪嘉行, 永田裕二, 津田雅孝:
環境細菌ゲノムの構造と可塑性 -難分解性化合物分解の総合職と専門職の場合-. 化学と生物 47(1): 35-42 (2009) |
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| GMB0004 | その他の出版物 | 永田裕二, 津田雅孝:
カイメン共在細菌メタゲノム中の環境汚染物質分解酵素遺伝子相同配列の解析. マリンメタゲノムの有効利用: 166-178 (2009) |
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| GMB0006 | その他の出版物 | K. Yamazaki, H. Inui:
Phytoremediation with genetically modified plants. Trends in Bioremediation and Phytoremediation: in press (2010) |
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| GMB0006 | その他の出版物 | 乾秀之, 大川秀郎:
５．植物のP450酵素系、５．１植物の二次代謝産物の生合成に関与するP450分子種. 「P450の分子生物学」: 217-224 (2009) |
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| GMB0007 | 原著論文 | Hirotatsu Murano, Takashi Otani,
Nobuyasu Seike, Mizuki Sakai:
Dieldrin uptake and translocation in plants growing in hydroponic medium. Environmental Toxicology and Chemistry 29(1): 142-148 (2010) |
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研究成果（平成20年度）
| 課題番号 | 発表区分 | 著者名: タイトル 雑誌名・学会名・URL 巻(号): ページ (発表年) |
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|---|---|---|---|---|
| GMB0004 | 原著論文 | G. Fuchu, Y. Ohtsubo, M. Ito, R.
Miyazaki, A. Ono, Y. Nagata, M. Tsuda
Insertion sequence-based cassette PCR: cultivation-independent isolation of gamma-hexachlorocyclohexane-degrading genes from soil DNA Appl Microbiol Biotechnol 79(4): 627-632 (2008) |
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| GMB0004 | 総説 | 永田裕二, 津田雅孝
カイメン共在細菌メタゲノム中の環境汚染物質分解酵素遺伝子相同配列の解析 マリンメタゲノムの有効利用: 217-224 (2009) |
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| GMB0006 | その他の出版物 | 乾秀之, 大川秀郎
５．植物のP450酵素系、５．１植物の二次代謝産物の生合成に関与するP450分子種 P450の分子生物学 第２版: 217-224 (2009) |
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