業績リスト
2013年8月22日更新
発現プロファイル（RTR） 研究成果の公表
研究成果（平成24年度）
| 課題番号 | 発表区分 | 著者名: タイトル 雑誌名・URL 巻(号): ページ (発表年) |
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|---|---|---|---|---|
| RTR0001 | 原著論文 | Y. Kawahara, Y. Oono, H. Kanamori,
T. Matsumoto, T. Itoh, E. Minami:
Simultaneous RNA-Seq Analysis of a Mixed Transcriptome of Rice and Blast Fungus Interaction. PLoS One 7(11):e49423(2012) |
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| RTR0002 | 原著論文 | H. Takehisa, Y. Sato, B. Antonio, Y. Nagamura:
Global transcriptome profile of rice root in response to essential macronutrient deficiency. Plant Signal Behav 8(6):e24409_1-6(2013) |
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| RTR0002 | 原著論文 | A. J. Nagano, Y. Sato, M. Mihara,
B. A. Antonio, R. Motoyama, H. Itoh, Y. Nagamura, T. Izawa:
Deciphering and Prediction of Transcriptome Dynamics under Fluctuating Field Conditions. Cell 151(6):1358-1369(2012) |
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| RTR0002 | 原著論文 | Y. Sato, H. Takehisa, K.
Kamatsuki, H. Minami, N. Namiki, H. Ikawa, H. Ohyanagi, K. Sugimoto, B. A.
Antonio, Y. Nagamura:
RiceXPro Version 3.0: expanding the informatics resource for rice transcriptome. Nucleic Acids Res 41(Database issue):D1206-1213(2012) |
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| RTR0002 | 原著論文 | Y. Sato, N. Namiki, H. Takehisa,
K. Kamatsuki, H. Minami, H. Ikawa, H. Ohyanagi, K. Sugimoto, J. I. Itoh, B.
A. Antonio, Y. Nagamura:
RiceFREND: a platform for retrieving coexpressed gene networks in rice. Nucleic Acids Res 41(Database issue):D1214-D1221(2012) |
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| RTR0002 | 原著論文 | K. Kobayashi, N. Yasuno, Y. Sato,
M. Yoda, R. Yamazaki, M. Kimizu, H. Yoshida, Y. Nagamura, J. Kyozuka:
Inflorescence meristem identity in rice is specified by overlapping functions of three AP1/FUL-like MADS box genes and PAP2, a SEPALLATA MADS box gene. Plant Cell 24(5):1848-1859(2012) |
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| RTR0002 | 原著論文 | S. Uraguchi, T. Kamiya, T.
Sakamoto, K. Kasai, Y. Sato, Y. Nagamura, A. Yoshida, J. Kyozuka, S.
Ishikawa, T. Fujiwara:
Low-affinity cation transporter (OsLCT1) regulates cadmium transport into rice grains. Proc Natl Acad Sci U S A 108(52):20959-20964(2011) |
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| RTR0004 | 原著論文 | A. J. Nagano, Y. Sato, M. Mihara,
B. A. Antonio, R. Motoyama, H. Itoh, Y. Nagamura, T. Izawa:
Deciphering and Prediction of Transcriptome Dynamics under Fluctuating Field Conditions. Cell 151(6):1358-1369(2012) |
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| RTR0006 | 原著論文 | Y. Sato, N. Namiki, H. Takehisa,
K. Kamatsuki, H. Minami, H. Ikawa, H. Ohyanagi, K. Sugimoto, J. I. Itoh, B.
A. Antonio, Y. Nagamura:
RiceFREND: a platform for retrieving coexpressed gene networks in rice. Nucleic Acids Res 41(D1):D1214-D1221(2013) |
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研究成果（平成23年度）
| 課題番号 | 発表区分 | 著者名: タイトル 雑誌名・URL 巻(号): ページ (発表年) |
|---|---|---|
| RTR0001 | 原著論文 | C. C. Yang, Y. Kawahara, H.
Mizuno, J. Wu, T. Matsumoto, T. Itoh:
Independent Domestication of Asian Rice Followed by Gene Flow from japonica to indica. Mol Biol Evol 29(5):1471-1479 (2012) |
| RTR0001 | 原著論文 | Mizuno H, Kawahara Y, Wu J,
Katayose Y, Kanamori H, Ikawa H, Itoh T, Sasaki T, Matsumoto T:
Asymmetric distribution of gene expression in the centromeric region of rice chromosome 5. Frontiers in Plant Science 2(jun):1-12 (2011) |
| RTR0001 | 原著論文 | H. Sakai, H. Mizuno, Y. Kawahara,
H. Wakimoto, H. Ikawa, H. Kawahigashi, H. Kanamori, T. Matsumoto, T. Itoh, B.
S. Gaut:
Retrogenes in rice (Oryza sativa L. ssp. japonica) exhibit correlated expression with their source genes. Genome Biol Evol 3:1357-1368 (2011) |
| RTR0001 | 原著論文 | Oono Y, Kawahara Y, Kanamori H,
Mizuno H, Yamagata H, Yamamoto M, Hosokawa S, Ikawa H, Akahane I, Zhu Z, Wu
J, Itoh T, Matsumoto T:
mRNA-Seq reveals a comprehensive transcriptome profile of rice under phosphate stress. Rice 4(2):50-65 (2011) |
| RTR0002 | 原著論文 | Y. Sato, B. Antonio, N. Namiki, R.
Motoyama, K. Sugimoto, H. Takehisa, H. Minami, K. Kamatsuki, M. Kusaba, H.
Hirochika, Y. Nagamura:
Field transcriptome revealed critical developmental and physiological transitions involved in the expression of growth potential in japonica rice. BMC Plant Biol 11:10 (2011) |
| RTR0002 | 原著論文 | Y. Ishimaru, Y. Kakei, H. Shimo,
K. Bashir, Y. Sato, N. Uozumi, H. Nakanishi, N. K. Nishizawa:
A rice phenolic efflux transporter is essential for solubilizing precipitated apoplasmic iron in the plant stele. J Biol Chem 286(28):24649-24655 (2011) |
| RTR0002 | 原著論文 | H. Takehisa, Y. Sato, M. Igarashi,
T. Abiko, B. A. Antonio, K. Kamatsuki, H. Minami, N. Namiki, Y. Inukai, M.
Nakazono, Y. Nagamura:
Genome-wide transcriptome dissection of the rice root system: implications for developmental and physiological functions. Plant J 69(1):126-140 (2011) |
| RTR0002 | 新聞、テレビなどの広報 | 長村吉晃, 佐藤豊, バルタザール アントニオ:
イネの遺伝子が「いつ、どこで、どの程度」発現しているかを解明し、それらの情報を公開- イネ科作物の遺伝子機能解明の加速化に貢献 -. 化学工業日報、日本農業新聞 (2011) |
| RTR0004 | 原著論文 | T. Izawa, M. Mihara, Y. Suzuki, M.
Gupta, H. Itoh, A. J. Nagano, R. Motoyama, Y. Sawada, M. Yano, M. Y. Hirai,
A. Makino, Y. Nagamura:
Os-GIGANTEA confers robust diurnal rhythms on the global transcriptome of rice in the field. Plant Cell 23(5):1741-1755 (2011) |
研究成果（平成22年度）
| 課題番号 | 発表区分 | 著者名: タイトル 雑誌名・URL 巻(号): ページ (発表年) |
|---|---|---|
| RTR0001 | 原著論文 | H. Mizuno, Y. Kawahara, H. Sakai,
H. Kanamori, H. Wakimoto, H. Yamagata, Y. Oono, J. Wu, H. Ikawa, T. Itoh, T.
Matsumoto:
Massive parallel sequencing of mRNA in identification of unannotated salinity stress-inducible transcripts in rice (Oryza sativa L.) BMC Genomics 11(1):683 (2010) |
| RTR0002 | 原著論文 | Y. Sato, B. A. Antonio, N. Namiki,
H. Takehisa, H. Minami, K. Kamatsuki, K. Sugimoto, Y. Shimizu, H. Hirochika,
Y. Nagamura:
RiceXPro: a platform for monitoring gene expression in japonica rice grown under natural field conditions Nucleic Acids Res 39(Database issue):D1141-1148 (2011) |
| RTR0005 | 原著論文 | Y. Saito, T. Shigemitsu, K.
Tanaka, S. Morita, S. Satoh, T. Masumura:
Ultrastructure of mature protein body in the starchy endosperm of dry cereal grain Biosci Biotechnol Biochem 74(7):1485-1487 (2010) |
| RTR0005 | 原著論文 | M. Kubota, Y. Saito, T. Masumura,
T. Kumagai, R. Watanabe, S. Fujimura, M. Kadowaki:
Improvement in the in vivo digestibility of rice protein by alkali extraction is due to structural changes in prolamin/protein body-I particle Biosci Biotechnol Biochem 74(3):614-619 (2010) |
| RTR0005 | 総説 | 増村威宏, 斉藤雄飛:
米の食味に関与する貯蔵タンパク質の米粒内分布の解析 農業および園芸 85(12):1235-1239 (2010) |
| RTR0005 | 総説 | 斉藤雄飛, 増村威宏:
米加工食品に役立つタンパク質の分析技術 New Food Industry 52(11):1-8 (2010) |
| RTR0005 | 総説 | 増村威宏:
米の成分（1）粒の生物的形成 食品と容器 51(10):592-599 (2010) |
研究成果（平成21年度）
| 課題番号 | 発表区分 | 著者名: タイトル 雑誌名・学会名・URL 巻(号): ページ (発表年) |
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|---|---|---|---|---|
| RTR0002 | 原著論文 | T. Sazuka, N. Kamiya, T.
Nishimura, K. Ohmae, Y. Sato, K. Imamura, Y. Nagato, T. Koshiba, Y. Nagamura,
M. Ashikari, H. Kitano, M. Matsuoka:
A rice tryptophan deficient dwarf mutant, tdd1, contains a reduced level of indole acetic acid and develops abnormal flowers and organless embryos. Plant J 60(2): 227-241 (2009) |
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| RTR0005 | 原著論文 | Y. Saito, K. Kishida, K. Takata,
H. Takahashi, T. Shimada, K. Tanaka, S. Morita, S. Satoh, T. Masumura:
A green fluorescent protein fused to rice prolamin forms protein body-like structures in transgenic rice. J Exp Bot 60(2): 615-627 (2009) |
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| RTR0005 | 原著論文 | Y. Saito, N. Nakatsuka, T.
Shigemitsu, K. Tanaka, S. Morita, S. Satoh, T. Masumura:
Thin frozen film method for visualization of storage proteins in mature rice grains. Biosci Biotechnol Biochem 72(10): 2779-2781 (2008) |
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| RTR0005 | 総説 | 増村威宏:
コメのおいしさはタンパク質が左右する？！. 化学 64(4): 76-77 (2009) |
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| RTR0005 | 総説 | 増村威宏:
イネ科種子タンパク質の生合成と蓄積. 種子の科学とバイオテクノロジー: 56-62 (2009) |
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| RTR0005 | 新聞、テレビなどの広報 | 増村威宏:
うまいコメ タンパク質次第. 京都新聞: (2009) |
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| RTR0005 | 新聞、テレビなどの広報 | 増村威宏:
米の食味 特定たんぱく質が鍵 粒表面の蓄積次第. 日本農業新聞: (2009) |
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研究成果（平成20年度）
| 課題番号 | 発表区分 | 著者名: タイトル 雑誌名・学会名・URL 巻(号): ページ (発表年) |
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|---|---|---|---|---|
| RTR0004 | 原著論文 | M. Mihara, T. Itoh, T. Izawa
In silico identification of short nucleotide sequences associated with gene expression of pollen development in rice Plant Cell Physiol 49(10): 1451-1464 (2008) |
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