アグリ・ゲノム研究の総合的な推進 [(旧)食料供給力向上のためのグリーンテクノ計画] ― イネゲノム研究 ―

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タンパク質の構造解析を利用した単離及び機能解明(〜平成16年度)
(略称:プロテオミクス、PR)

概 要 研究課題名等 研究成果の公表

最終更新日: 2005/05/27
研究課題名・担当機関一覧 と 課題数 

課題番号 大課題名
PR1101〜PR1500 タンパク質の構造・機能の網羅的解析と有用遺伝子の単離・機能解明
PR2101〜PR2213 タンパク質の立体構造と機能の相関解明
PR3001〜PR3007 タンパク質の立体構造と機能の予測手法の開発
PR4001〜PR4210 タンパク質立体構造に基づく未知遺伝子の機能解明
及びタンパク質間相互作用の解明

↓課題番号をクリックすると、各課題の研究成果を見ることができます。

課題番号 研究課題名 研究期間 機関 研究室
PR1101 細胞周期で変動するタンパク質の網羅的解析と遺伝子単離・機能解明 12〜14 農業生物資源研究所 遺伝資源研究グループ 上席研究官
PR1102 発芽種子タンパク質の網羅的解析及び発芽力調節に関与する遺伝子単離と機能解明 12〜14 新潟大学 農学部 応用生物化学科
PR1103 イネ生殖器官で発現するタンパク質の網羅的解析と遺伝子単離・機能解明 12〜14 北海道農業研究センター 地域基盤研究部 冷害生理研究室
PR1104 イネミトコンドリア局在性タンパク質の網羅的解析と遺伝子単離・機能解明 12〜14 北海道農業研究センター 地域基盤研究部 適応生態研究室
PR1105 イネ葉緑体移行性タンパク質の網羅的解析とシグナル配列の構造及び機能の解析 12〜14 三菱化学生命科学研究所 トランスレイショナル研究部 プロテイン工学研究ユニット
PR1106 イネ細胞膜タンパク質の網羅的解析と耐冷性に関連した有用遺伝子単離・機能解明 12〜13 岩手大学 農学部附属寒冷バイオシステム研究センター
PR1107 イネ核内タンパク質の網羅的解析と有用遺伝子単離・機能解明 12〜14 筑波大学 生物科学系 植物生理学研究室
PR1108 分泌シグナルを指標とした細胞壁構築タンパク質の網羅的解析と有用遺伝子単離 ・機能解明 12〜14 東北大学大学院 生命科学研究科 生命機能科学専攻
PR1109 酵素阻害タンパク質の網羅的解析と遺伝子単離及び阻害機能発現との関係の解明 12〜13 食品総合研究所 食品素材部 穀類特性研究室
PR1201 茎葉伸長等に関与する植物ホルモンに応答して変化するタンパク質の網羅的解析と遺伝子単離・機能解明 12〜14 農業生物資源研究所 分子遺伝研究グループ 遺伝子応答研究チーム
PR1202 放射線及び継代培養によって出現した突然変異体イネの分析 12〜13 農業生物資源研究所 生体高分子研究グループ 生体膜機能研究チーム
PR1203 放射線突然変異体イネ胚乳タンパク質の網羅的解析とアレルゲンタンパク質遺伝子の単離・機能解明 12〜14 農業生物資源研究所 放射線育種場 突然変異遺伝子研究チーム
PR1204 根における環境応答タンパク質の網羅的解析と有用遺伝子単離・機能解明 12〜14 東京都立大学 理学研究科 生物科学専攻 植物分子細胞生物学講座
PR1205 低温ストレスでイネ組織に蓄積するタンパク質の網羅的解析と遺伝子単離・機能解明 12〜14 北海道農業研究センター 地域基盤研究部 越冬ストレス研究室 
PR1206 イネ葯特異的糖タンパク質の網羅的解析と低温耐性遺伝子機能の解明 12〜14 北海道農業研究センター 地域基盤研究部 冷害生理研究室
PR1207 イネ科植物培養細胞系における温度ストレス耐性に関与するアブシジン酸反応性タンパク質の網羅的解析と遺伝子単離・機能解明 12〜14 農業生物資源研究所 遺伝資源研究グループ 限界機能研究チーム
PR1208 ジベレリン合成系遺伝子を導入した形質転換イネにおける他の遺伝子発現産物の変動 12〜13 農業生物資源研究所 新生物資源創出研究グループ 新作物素材開発研究チーム
PR1209 米の品質形成・特性に関与するタンパク質の網羅的解析及び遺伝子単離・機能解明 12〜13 中央農業総合研究センター 北陸地域基盤研究部  米品質評価研究室 
PR1210 窒素栄養の異なるイネにおいていもち病感染により誘起されるレース非特異的抵抗反応関連タンパク質の網羅的解析と遺伝子単離・機能解明 12〜13 東北農業研究センター 地域基盤研究部  病害管理研究室
PR1211 イネいもち病菌感染初期にイネいもち病菌およびイネで発現するタンパク質の機能解析 14〜14 農業生物資源研究所 遺伝資源研究グループ 多様性評価研究チーム
PR1212 イネ細胞表層分子と相互作用するタンパク質の網羅的解析 14〜14 食品総合研究所 生物機能開発部 分子情報研究室
PR1213 多窒素・冷温ストレスにより変動するイネ葯タンパク質の網羅的解析と多窒素冷害に関与する遺伝子単離と機能解明 14〜14 東北農業研究センター 地域基盤研究部 環境生理研究室
PR1214 ジスルフィドプロテオームを利用したイネの新規蛋白質の探索と機能解析 14〜14 中央農業総合研究センター 北陸地域基盤研究部 米品質評価研究室
PR1215 オーキシンの機能発現と共役する亜鉛誘導性タンパク質の網羅的解析と遺伝子単離・機能解明 14〜14 宮崎大学 農学部 応用生物科学科
PR1216 イネジベレリンシグナル伝達に関わる因子の網羅的探索と解析 14〜14 名古屋大学 生物分子応答研究センター 内環境応答統御研究室
PR1217 低リンに応答するタンパク質の網羅的解析と遺伝子単離・機能解明 14〜14 北海道大学大学院 農学研究科 植物機能開発学研究室
PR1301 出芽酵母を用いた細胞骨格タンパク質の機能とその多様性解析 12〜13 農業生物資源研究所 遺伝資源研究グループ 多様性評価研究チーム
PR1302 GFP融合ライブラリーを利用した酵母タンパク質の構造と機能の解析 12〜13 食品総合研究所 応用微生物部 酵母研究室
PR1401 質量分析法によるイネ組織・時期特異的超微量タンパク質の解析及び翻訳後修飾情報(糖タンパク質)の構造解析 12〜14 大阪大学 蛋白質研究所 機能・発現プロテオミクス研究系
PR1402 質量分析法によるイネ組織・時期特異的超微量タンパク質の解析及び翻訳後修飾情報(リン酸化タンパク質)の構造解析 12〜14 アプライドバイオシステムズジャパン(株) プロテオミクス リサーチ
PR1403 イネ葉茎根の生育過程の2次元解析とそのタンパク質の修飾を含めシーケンサー及び化学特異的分解−質量分析による同定 12〜14 東京理化器械(株) プロテオミクス研究所
PR1404 質量スペクトルを利用した胚芽タンパク質の網羅的解析、遺伝子同定と翻訳後修飾の解析 12〜14 横浜市立大学 木原生物学研究所 植物工学部門
PR1500 イネ・プロテオーム解析システムの構築及び組織特異的・生育時期特異的・細胞内局在性タンパク質の網羅的解析 14〜14 農業生物資源研究所 分子遺伝研究グループ 遺伝子応答研究チーム
PR2101 タンパク質のフォルディング情報の解読とその応用 12〜14 九州大学大学院 薬学研究科 免疫薬品学研究室
PR2102 疎水性タンパク質の構造形成機構の解明 12〜14 食品総合研究所 食品素材部 タンパク質素材研
PR2103 ランダムタンパク質ライブラリーからの進化的立体構造形成 12〜14 大阪大学大学院 工学研究科応用生物工学専攻 進化生命システム学研
PR2104 分子シャペロンによるタンパク質の立体構造形成機構とその制御機構の解明 12〜14 鳥取大学 工学部 生物応用工学科
PR2105 人工シャペロンによるタンパク質の立体構造制御 12〜14 食品総合研究所 応用微生物部 生物変換研究室 
PR2106 X線解析に基づく有用酵素の立体構造解析 12〜14 農業生物資源研究所 生体高分子研究グループ 蛋白機能研究チーム
PR2107 ADPを燐酸供与体とする新規ヘキソキナーゼの結晶構造と機能解析 12〜14 東京大学大学院 農学生命科学研究科応用生命工学専攻 酵素学研究室
PR2108 アミノ糖N−脱アセチル化酵素の高次構造情報に基づく触媒作用の制御 12〜14 食品総合研究所 応用微生物部 生物変換研究室 
PR2109 新規ペプチダーゼ活性化タンパク質の構造と機能発現の解明 12〜14 食品総合研究所 応用微生物部 発酵細菌研究室
PR2110 生体防御関連タンパク質の立体構造と機能の解析 12〜14 農業生物資源研究所 生体防御研究グループ 先天性免疫研究チーム
PR2111 種子LEAタンパク質の構造と機能の解明 12〜14 食品総合研究所 食品素材部 タンパク質素材研究室
PR2201 NMRと分子シミュレーションによる蛋白質複合体の溶液構造と認識機構の解明 12〜14 農業生物資源研究所 生体高分子研究グループ 超分子機能研究チーム
PR2202 高機能タンパク質のX線結晶構造解析 12〜14 京都大学 化学研究所 構造解析基礎研究部門T
PR2203 構造蛋白質の高次構造と機能発現機構の解明 12〜14 農業生物資源研究所 昆虫新素材開発研究グループ 素材特性研究チーム
PR2204 金属含有酵素の立体構造形成機構と機能発現との関係解明 12〜14 食品総合研究所 生物機能開発部 酵素機能研究室
PR2205 糖転移酵素の立体構造に基づく基質特異性の改変 12〜14 食品総合研究所 食品素材部 糖質素材研究室
PR2206 エキソグリコシダーゼの構造と機能発現機構の解明 12〜14 食品総合研究所 生物機能開発部 分子情報研究室
PR2207 ダイズβ−アミラーゼの分子解剖学的手法による機能残基の同定 12〜14 食品総合研究所 企画調整部 タンパク質分子設計チーム
PR2208 ジェリーロール構造を有する酵素の構造機能相関の解明 12〜14 森林総合研究所 きのこ・微生物研究領域 微生物工学研究室
PR2209 糖鎖認識蛋白質の立体構造と糖鎖認識能発現との相関関係 12〜14 山形大学 理学部  物質生命化学科
PR2210 核タンパク質HMGの高次構造・機能解析とHMGボックスタンパク質群の機能予測 12〜14 東京理科大学 基礎工学部 吉田研究室
PR2211 セルロソーム形成機構の解明と人工酵素複合体の設計 12〜14 三重大学 生物資源学部 微生物工学研究室
PR2212 枯草菌蛋白質分泌系で作用するシグナル認識粒子(SRP)の構造と機能 12〜14 筑波大学 生物科学系 山根研究室
PR2213 タンパク質輸送配列の特定と機能発現の相関解明 12〜14 農業生物資源研究所 遺伝資源研究グループ 遺伝子多様性研究チーム
PR3001 特定機能タンパク質におけるデータマイニング技術による確率的共通項抽出技術 12〜14,
15〜16
日本電気(株) 基礎・環境研究所
PR3002 アミノ酸配列モチーフ情報を利用した遺伝子の機能予測 12〜14,
15〜16
(株)三菱総合研究所 先端科学研究センター
PR3003 ホモロジーによらないタンパク質立体構造・機能予測手法の開発 12〜14 東京大学大学院 農学生命科学研究科 生物情報工学研究室
九州大学大学院 生物資源環境科学研究科 生物化学分野
PR3004 タンパク質情報のデータベース化 12〜14,
15〜16
農業生物資源研究所 ゲノム研究グループ DNAバンク
PR3005 生体内分子の3次元構造データベースの構築 12〜14 農業生物資源研究所 生体高分子研究グループ 超分子機能研究チーム
PR3006 ホモロジーモデリングと ab initio 法の統合によるタンパク質構造予測手法の開発 15〜16 東京大学大学院 農学生命科学研究科 生物情報工学研究室
PR3007 転写・翻訳関連タンパク質予測法の開発 15〜16 九州大学大学院 農学研究院 生物化学研究室
PR4001 イネ完全長cDNAの効率的発現系の構築と精製法の開発 13〜13 農業生物資源研究所 生体高分子研究グループ 蛋白機能研究チーム
PR4101 タンパク質立体構造解析に基づく遺伝子機能の解明 14〜16 農業生物資源研究所 生体高分子研究グループ 超分子機能研究チーム
生体高分子研究グループ 蛋白機能研究チーム
大阪大学大学院 工学研究科 物質化学専攻
東京工業大学大学院 生命理工学研究科
長岡技術科学大学 生物系 蛋白質工学研究室
京都大学大学院 農学研究科 品質設計開発学分野
理学研究科
化学専攻
生物構造化学研究室
熊本大学大学院 医学薬学研究部 機能分子構造解析学分野
北海道大学大学院 薬学研究科 構造生物学分野
富山医科薬科大学 薬学部 構造生物学研究室
奈良先端科学技術大学院大学 バイオサイエンス研究科 生体高分子構造学講座
PR4201 質量分析法を利用した親和性タンパク質の同定法の開発 14〜16 農業生物資源研究所 生体高分子研究グループ 生体膜機能研究チーム
PR4202 タンパク質間相互作用解析法を用いたシグナル伝達系ネットワークの解析 14〜16 農業生物資源研究所 生理機能研究グループ 光合成研究チーム
PR4203 茎葉伸長等に関与する植物ホルモンに応答して変化するタンパク質の網羅的解析と遺伝子単離・機能解明 15〜16 農業生物資源研究所 分子遺伝研究グループ 遺伝子応答研究チーム
PR4204 根における環境応答タンパク質の網羅的解析と有用遺伝子単離・機能解明 15〜16 東京都立大学 理学研究科
生物科学専攻
植物分子細胞生物学講座
PR4205 イネいもち病菌感染初期にイネいもち病菌およびイネで発現するタンパク質の機能解析 15〜16 農業生物資源研究所 遺伝資源研究グループ 多様性評価研究チーム
PR4206 多窒素・冷温ストレスにより変動するイネ葯タンパク質の網羅的解析と多窒素冷害に関与する遺伝子単離と機能解明 15〜16 東北農業研究センター 地域基盤研究部 環境生理研究室
PR4207 ジスルフィドプロテオームを利用したイネの新規蛋白質の探索と機能解析 15〜16 中央農業総合研究センター 北陸地域基盤研究部 米品質研究チーム
PR4208 オーキシンの機能発現と共役する亜鉛誘導性タンパク質の網羅的解析と遺伝子単離・機能解明 15〜16 宮崎大学 農学部 応用生物科学科
PR4209 イネ葉茎根の生育過程の2次元解析とそのタンパク質の修飾を含めシーケンサー及び化学特異的分解−質量分析による同定 15〜16 東京理化器械(株) プロテオミクス研究所
PR4210 新しい基板を用いたタンパク質−タンパク質相互作用の解析 15〜16 横浜市立大学 木原生物学研究所

研究課題数(〜平成16年度)

参画研究機関の区分 研究年次
12 13 14 15 16
独立行政法人
農業生物資源研究所
14 15 16 6 6
その他の農林水産関係
独立行政法人
19 19 17 2 2
大学 17 17 19 5 5
民間 4 4 5 3 3
研究課題数(計) 54 55 57 16 16

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