作物ゲノム育種研究センター

イネゲノムリンク集

イネ

■ 品種特性

イネ品種・特性データベース


■ ゲノム横断

DDBJ
塩基配列データを収集し公開(国立遺伝学研究所)


NBRP
実験動植物や微生物等のバイオリソース収集・保存・提供(国立遺伝学研究所)


PGCBj
日本の植物ゲノムデータベース(かずさDNA研究所)


NIAS Genebank
遺伝資源・ジーンバンク(農業生物資源研究所)


AgrID (NIAS)
農畜産物ゲノム情報データベース(農業生物資源研究所)


Phytozome
比較ゲノミクスのデータベース(Joint Genome Institute)


PlantGDB
植物の比較ゲノミクスのページ(Iowa State University, National Science Foundation)


■ 総合

Oryzabase (NIG)
イネの総合データベース(国立遺伝学研究所)


Rice TOGO Browser (NIAS)
イネのゲノム情報を統合したデータベース(農業生物資源研究所)


■ 遺伝資源・実験材料

NIASジーンバンク・植物遺伝資源部門
ジーンバンク植物遺伝資源部門(農業生物資源研究所)


NIAS DNAバンク
DNAバンク(農業生物資源研究所)


Kyushu Univ. Rice Database
イネ系統保存データベース(九州大学)


rgrc
イネゲノムリソースセンター(農業生物資源研究所)


Tos17
レトロトランスポゾンT突然変異系統(農業生物資源研究所)


■ DNAマーカー

SNP Table (Japan)
日本稲SNPデータベース(農業生物資源研究所)


NIAS Oryza SNP Database
NIASコアコレクションSNPデータベース(農業生物資源研究所)


■ 表現型・機能遺伝子

Q-TARO
QTL情報のデータベース(農業生物資源研究所)


OGRO
機能遺伝子データベース(農業生物資源研究所)


■ 遺伝子配列・ゲノムアノテーション

RAP-DB
遺伝子アノテーションデータベース(農業生物資源研究所)


TASUKE
配列変異描画ブラウザ(農業生物資源研究所)


SALAD-DB
保存領域を基盤とするタンパク質配列をゲノムワイドに比較(農業生物資源研究所)


■ 遺伝子発現

RiceXPro
遺伝子発現プロファイル(農業生物資源研究所)


RiceFREND
遺伝子共発現データベース(農業生物資源研究所)


Fit-DB
圃場遺伝子発現データベース(農業生物資源研究所)

法人番号 7050005005207